蓝藻细胞（蓝细菌）和酵母菌细胞是两种不同的微生物，它们在结构、代谢方式以及分类上都有所区别。

1. **结构上的差异**：
- **蓝藻细胞**：属于原核生物，没有真正的细胞核和其他膜包被的细胞器。它们的DNA裸露且集中在细胞内的一个区域，称为拟核。
- **酵母菌细胞**：属于真核生物，具有完整的细胞核和其他膜包被的细胞器，如线粒体。这使得酵母菌能够进行更复杂的代谢活动。

2. **代谢方式**：
- **蓝藻细胞**：多数为光能自养型，即通过光合作用将二氧化碳和水转化为有机物，并释放氧气。也有一些种类可以进行化学自养或异养。
- **酵母菌细胞**：主要为化能有机营养型，通过分解有机物获取能量。一些酵母菌可以在有氧条件下进行呼吸作用，在无氧条件下则进行发酵。

3. **分类学差异**：
- **蓝藻细胞**：属于细菌界，具体来说是蓝细菌门。
- **酵母菌细胞**：属于真菌界，具体来说是子囊菌门或担子菌门中的某些物种。

4. **形态大小**：
- **蓝藻细胞**：通常较小，单个细胞直径一般在几微米左右。
- **酵母菌细胞**：相对较大，单个细胞直径大约在几到几十微米之间。

这些差异反映了这两种微生物在进化树上的不同位置以及适应环境的方式。